真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，

性格懦弱的少女纪多满（桑岛法子配音）有一个秘密。她可以看到别人所无法看到的东西，譬如脖子上的黑环，一旦黑环很深，死神就要来到。而这个黑环，她在她的同学赤月知佳（铃村健一配音）和橘司徒（樱井孝宏配音）的